2006. szeptember 25-e óta működik a GBEP Titkársága (Globális Bioenergetikai Együttműködést Összehangoló Titkárság), melynek megnyitását még 2006. májusban indítványozta az ENSZ New York-i Fenntartható Fejlődésért Bizottság 14. ülése – olvasható a FAO honlapján.
A titkárság megbízatása, hogy segítse és megkönnyítse egy bioenergiát népszerűsítő globális politikai fórum munkáját, ösztönözze a „zöld üzemanyagok” termelését, piaci terjesztését és felhasználását, különös tekintettel a fejlődő országokra.
Rövid távon, a titkárság aktualizálja a bioenergiával foglalkozó nyilvántartási hálózatokat, kezdeményezéseket és intézményeket, valamint azonosítja az esetleges ismeretbeli hiányosságokat. Segíti a feleket a két- és többoldalú, a fenntartható bioenergetikai fejlesztéseket szolgáló projektek beazonosításában és megvalósításában. Támogatja az olyan irányadó útmutatások kialakítását, melyekkel a bioüzem- és fűtőanyagok használatának köszönhetően, mérhető a GHG, a globális felmelegedést kiváltó, üvegház-hatású gázkibocsátás csökkenése.
A GBEP jelenlegi partner országai: valamennyi G8 ország (Kanada, Franciaország, Németország, Olaszország, Japán, Oroszország, az Egyesült Királyság és az USA), továbbá Kína, Mexikó, a Nemzetközi Energia Ügynökség (IEA), az ENSZ Alapítványa, az Európai Biomassza Ipari Szövetség (EUBIA) és a FAO. Az elkövetkező két évre Olaszországot és Mexikót nevezték ki a GBEP Összehangoló Bizottságának elnöki, illetve elnökhelyettesi tisztére.